Wagadugoløbet er en dyst for rigtige spejder patruljer på spejderfærdigheder i en spændende handling, der foregår i 1930´ernes gangstermiljø.

Spejderne assisterer Politiets Efterretnings Tjeneste i optrævlingen af organiserede kriminelle bander. De lokale gangstere, anført af mafiabossen Kaj Olsen, kaldet "Skallesmækker", er i åbent opgør med det Italienske De Quiello kartel om indsmugling af smugler gods til den danske underverden. Med et tip fra Skallesmækkers veninde, den verdenskendte variete´ sangerinde Lullu Bell, var det nær lykkedes spejderne at fange Skallesmækker sidste år. Med nød og næppe undslap han i et ventende fly. Jagten på ham fortsætter.